MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marivirga tractuosa DSM 4126 plasmid pFTRAC01

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014750	CCT	2	6	6	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014750	AAC	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014750	AGA	2	6	143	148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014750	CAG	2	6	176	181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014750	CGAG	2	8	285	292	25 %	0 %	50 %	25 %	313652077
6	NC_014750	AAC	2	6	325	330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313652077
7	NC_014750	TCC	2	6	379	384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313652077
8	NC_014750	AAGC	2	8	417	424	50 %	0 %	25 %	25 %	313652077
9	NC_014750	ACAGGC	2	12	441	452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313652077
10	NC_014750	GGA	2	6	462	467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313652077
11	NC_014750	GAAG	2	8	494	501	50 %	0 %	50 %	0 %	313652077
12	NC_014750	A	7	7	540	546	100 %	0 %	0 %	0 %	313652077
13	NC_014750	ATG	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652077
14	NC_014750	ACA	2	6	637	642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313652077
15	NC_014750	GAA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652077
16	NC_014750	GAAA	2	8	659	666	75 %	0 %	25 %	0 %	313652077
17	NC_014750	AGCA	2	8	735	742	50 %	0 %	25 %	25 %	313652077
18	NC_014750	A	6	6	835	840	100 %	0 %	0 %	0 %	313652077
19	NC_014750	CAAC	2	8	881	888	50 %	0 %	0 %	50 %	313652077
20	NC_014750	AAG	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652077
21	NC_014750	CAT	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313652077
22	NC_014750	A	6	6	1132	1137	100 %	0 %	0 %	0 %	313652077
23	NC_014750	ACA	2	6	1148	1153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313652077
24	NC_014750	GAA	2	6	1288	1293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652078
25	NC_014750	CA	3	6	1711	1716	50 %	0 %	0 %	50 %	313652078
26	NC_014750	AGAA	2	8	1751	1758	75 %	0 %	25 %	0 %	313652078
27	NC_014750	GAA	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652078
28	NC_014750	GAAA	2	8	1833	1840	75 %	0 %	25 %	0 %	313652079
29	NC_014750	AGA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652079
30	NC_014750	GAT	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652079
31	NC_014750	ACA	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313652079
32	NC_014750	A	7	7	1958	1964	100 %	0 %	0 %	0 %	313652079
33	NC_014750	TTTC	2	8	2055	2062	0 %	75 %	0 %	25 %	313652080
34	NC_014750	CCA	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313652080
35	NC_014750	ATG	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313652080
36	NC_014750	T	7	7	2221	2227	0 %	100 %	0 %	0 %	313652080
37	NC_014750	TAA	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014750	AGA	2	6	2312	2317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014750	CTT	2	6	2437	2442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652081
40	NC_014750	AAGG	2	8	2475	2482	50 %	0 %	50 %	0 %	313652081
41	NC_014750	TCC	2	6	2498	2503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313652081
42	NC_014750	TTA	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014750	TTTC	2	8	2588	2595	0 %	75 %	0 %	25 %	313652082
44	NC_014750	ATA	2	6	2906	2911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313652083
45	NC_014750	AGA	2	6	2927	2932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652083
46	NC_014750	TTCTT	2	10	3047	3056	0 %	80 %	0 %	20 %	313652083
47	NC_014750	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	313652083
48	NC_014750	CTT	2	6	3074	3079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652084
49	NC_014750	CAG	2	6	3098	3103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313652084
50	NC_014750	TTTTC	2	10	3146	3155	0 %	80 %	0 %	20 %	313652084
51	NC_014750	TA	3	6	3191	3196	50 %	50 %	0 %	0 %	313652084
52	NC_014750	CTT	2	6	3212	3217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652084
53	NC_014750	TCTTT	2	10	3288	3297	0 %	80 %	0 %	20 %	313652084
54	NC_014750	GGC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313652084
55	NC_014750	TCAAT	2	10	3464	3473	40 %	40 %	0 %	20 %	313652084
56	NC_014750	TCT	2	6	3527	3532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652084
57	NC_014750	TCCA	2	8	3538	3545	25 %	25 %	0 %	50 %	313652084
58	NC_014750	TTC	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652084
59	NC_014750	AT	3	6	3593	3598	50 %	50 %	0 %	0 %	313652084
60	NC_014750	GATT	2	8	3719	3726	25 %	50 %	25 %	0 %	313652084
61	NC_014750	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	313652084
62	NC_014750	AAG	2	6	3845	3850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313652084
63	NC_014750	CCA	2	6	4007	4012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313652084
64	NC_014750	TCT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652084
65	NC_014750	CTT	2	6	4114	4119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313652084
66	NC_014750	ATA	2	6	4145	4150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014750	AGT	2	6	4153	4158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014750	A	6	6	4161	4166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014750	AAT	2	6	4201	4206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014750	CCACT	2	10	4216	4225	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_014750	TAC	2	6	4292	4297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014750	A	6	6	4326	4331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014750	GAT	2	6	4352	4357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014750	CAAAA	2	10	4399	4408	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014750	A	7	7	4418	4424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014750	CCA	2	6	4443	4448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014750	GC	3	6	4466	4471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014750	TA	3	6	4476	4481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014750	TA	3	6	4493	4498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014750	A	6	6	4498	4503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014750	A	7	7	4677	4683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014750	GTA	2	6	4698	4703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014750	T	6	6	4704	4709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014750	TGG	2	6	4788	4793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014750	TGTT	2	8	4813	4820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014750	AG	4	8	4883	4890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.